למרות מיקומו של הבניין, כמאות מטרים מדרום לכותל המערבי, ההגעה למקום נעשית על ידי ליווי מאבטחים ורכבים ממוגני ירי. "בית יהונתן" סובל מהתנכלויות יום יומיות מצד שכניו הערבים, והאחיזה במקום לאורך שנים נשמרת בעז"ה אודות למסירות נפשם של תושבי המקום ולומדיו.

"בית יהונתן" מהווה נדבך חשוב ברצף ההתיישבות היהודית במזרח ירושלים, יחד עם השכונות: "בית אורות", "מעלה הזיתים", "עיר דוד" ו"נוף ציון".

להרחבה היסטורית על התיישבות התימנים ב"כפר השילוח" לחץ כאן!

בראשות הכולל עומד הרב שמואל שטרן שליט"א, בוגר ישיבת "מרכז הרב" ור"מ לשעבר בישיבות "אור עציון" ו"עטרת נחמיה" בתל אביב.

בכולל לומדים גמרא בעיון, את כל סדר מועד דף אחר דף, מיסודות הסוגיה ועד לפסקי ההלכה. כמו כן, נלמדים בעומק נושאים באמונה, ברוח  הראי"ה קוק זצ"ל ובית מדרשו.

מטרת הכולל להכשיר תלמידי חכמים לתפקידי רבנות וחינוך מתוך ידיעה עמוקה ורחבה בסוגיות ההלכתיות ונכוּנות להעמדת התורה בכל גודלה בעם ישראל.